Le 25 Mai 1608, jour de la Pentecôte à Faverney, le Saint Sacrement est exposé dans un Ostensoir installé sur un reposoir de bois d’un mètre de haut, recouvert de draperies, le tout surmonté d’un dais festonné. A côté deux chandeliers et deux lampes à huile qui devaient brûler jour et nuit devant la Saint-Sacrement. Le lundi matin en ouvrant l’église le sacristain trouva l’édifice enfumé et vit les débris brûlés du reposoir et des chandeliers jonchant le sol, mais aucune trace de l’Ostensoir. Il prévient les moines de l’Abbaye. Un moine novice, lève la tête et découvre l’Ostensoir ni retenu, ni supporté par rien et suspendu en l’air au dessus des restes carbonisés. Le miracle dure pendant 33 heures, et des milliers de personnes en sont témoins.

L’Ostensoir, contenait deux hosties accolées qui étaient restées intactes. L’une, fut transportée à Dole alors capitale de la Franche Comté et disparu lors de la Révolution. C’est le courage de la femme du Maire qui a permis la conservation de la seconde, elle confia l’hostie à des personnes sûres, alors que son époux voulait la faire brûler au moment du partage des biens de l’abbaye à la Révolution. Grâce à cette femme elles est toujours là : petit rond brun de 41 millimètres de diamètre, exposé chaque année le lundi de Pentecôte à Faverney. L’enquête dilligentée par l’évêque de Besançon dès le 30 mai 1608, ayant recueilli des témoignages concordants auprès de nombreux témoins conclue à la véracité des faits et au miracle.